仕事は必ずしも原理原則をのっとってやるべきなのでしょうか

仕事は必ずしも原理原則をのっとってやるべきなのでしょうか。
ある仕事を、マニュアル通りに進めるとものすごく時間がかかります。しかしマニュアルとは違うけれど、手間を半減させ、同じ結果を出せる方法があるのでその方法でやろうとしていたところ、上司にマニュアル通りにやるよう注意を受けました。
マニュアル通りに進めると残業必至です。私は定時に帰りたいし、残業すれば残業代を出す組織側も損失だと思うので、本当に何も良いことがないと思うのですが、、とりあえず上司にはマニュアル通りやりますと言っておいて、こっそり簡単な方法でやるつもりです。
普通の会社はこのような方針なのでしょうか？